南京自驾车能否自由进出，取决于疫情防控政策的具体要求。如果南京处于疫情低风险地区，且没有特殊管控措施，一般情况下自驾车可以自由进出。如果南京处于疫情中高风险地区，或有特殊管控措施，则自驾车进出可能会受到限制，需要持有核酸检测阴性证明或其他证明材料，并遵守相关疫情防控规定。具体情况请以官方发布的最新政策为准。