先到参保地的经办机构办理转诊备案手续，将就医地的相关票据、报销材料准备好。
就医地就医，办理新农合住院手续。
住院治疗，注意保存好相关票据和报销材料。
出院后，携带患者身份证（或户口本）、新农合医疗证、病历复印件、住院结算单（有的是发票形式的）、住院费用清单、转诊备案手续到合管办报销。
需要注意的是，就医单位必须是当地的新农合定点医疗机构，否则不予报销。
此外，报销后，一般是半个月之内会拿到，但每个地方的办事效率不一样，有的地方可能会推迟。
省内的县转市建议一个月以内报销，跨省的建议在三个月之类报销。