医保卡不能使用基金支付，主要是因为医保中的基金支付，也就是统筹基金支付，是指用统筹账户资金支付参保人相关医疗费用。这种支付方式不记入个人账户部分的缴费。

统筹基金的使用有两种情况：第一种是医保定点机构的住院（非生育，非工伤的情况），起付线以上，社保目录内发生的费用可以按比例报销；第二种是门诊统筹门规病种，由社会保险行政部门确定，需长期门诊治疗，费用由医保统筹基金按规定比例支付的部分大病和慢病。

因此，当您在药店或门诊使用医保卡刷卡消费时，实际上是使用的个人账户部分的资金，而非统筹基金。这也是为什么医保卡不能用来支付基金的原因。