甘谷辣椒的种植历史至少有400多年。

明朝天启年间，甘谷辣椒通过经商旅贸易引入并开始在当地种植。

明叶应甲所编的《伏羌县志》（1627年）中就有关于甘谷辣椒的记载。在明末清初时期，甘谷辣椒曾作为宫廷贡品而享誉陇上。