结构不同

从结构上来说，酵母菌是真核细胞构成的真核生物，而乳酸菌是原核细胞构成的原核生物。真核细胞内的遗传物质被核膜包围起来形成细胞核，而原核细胞内的遗传物质则没有核膜包围，也就是不形成细胞核。

2、生存条件不同

酵母菌既能在有氧气的条件下生存，也能在无氧气的条件下生存并产生酒精；而乳酸菌则只能在无氧气的条件下才能生活，并产生乳酸。

3、细胞核不同

酵母菌有成形的细胞核；乳酸菌无成形的细胞核。