要将《水之纪元》入库，需要先在图书馆系统中新建一本书的档案，包括书名、作者、出版社等相关信息。然后将实体书进行标识（例如ISBN码、条形码等），并录入系统，与档案进行匹配。

最后，根据图书馆的分类体系，将《水之纪元》归入相应的类别中，并放置于相应的书架上，以方便借阅。同时，需要对该书进行分类号、编号等标注，以便读者查找、借阅。

入库前也需对书籍进行检查，以保证书籍质量，并进行盘点，确保馆内藏书的数量与库存量一致。