如果农行e贷的借款人利息在到期后仍未及时还款，导致利息晚扣两天，则可能会影响借款人的信用记录。银行一般会将逾期信息上传到个人征信机构，如人民银行征信中心，对个人信用记录造成不良影响。因此，借款人应及时还款，避免逾期情况发生，保护个人信用记录。