需要进行。

因为农村信用社房屋的所有权往往比较复杂，很多土地村民自有房产，这些房屋的所有权证明不一定能够保障其合法性，容易引发纠纷。

同时，可以防止房屋被不法分子侵占，避免一些不良后果的发生。

如果对这些房屋进行了确权登记，可以方便查询房屋的产权，减少房屋买卖等交易中发生的争议，保障农民的房产安全。

此外，确权登记也有助于促进土地集约利用和农村土地流转。