在杭州跑外卖并缴纳灵活就业医保，可以按照以下步骤操作：

1. 准备相关材料。包括身份证、户口本、社保卡等，具体所需材料可能因各地要求而有所不同，建议咨询当地医保部门或社保局获取具体信息。

2. 前往当地社保局或医保部门进行咨询和办理。在办理前，需要填写相关表格并提交相关材料，经审核通过后即可办理。

3. 缴纳医保费用。可以选择不同的缴费方式，如银行转账、支付宝、微信等，根据实际情况选择最方便的方式进行缴纳。

4. 领取医保卡。在办理完医保手续后，需要到当地社保卡服务网点领取医保卡。在领取时需要携带身份证、社保申请表等相关材料。