三沙水运运输主要以渔业运输和旅游客运为主，主要运输工具是船只。三沙的海域较为复杂，加之海上气象条件不稳定，导致水运运输相对困难。由于三沙地处南海，渔业资源丰富，因此渔业运输占据了很大比例。此外，三沙也在大力发展旅游业，水运客运也逐渐成为了三沙水运运输的一个重要组成部分。总体来说，三沙水运运输面临的挑战较多，但其在渔业和旅游业方面的潜力值得期待。