不会。

在单位自动离职了，社保不会清零。参保人员中断缴纳养老保险后，其中断期间不计缴费年限，个人账户由社保机构予以保留，并继续计息，重新缴费后，前后缴费年限合并计算，个人账户储存额累计计算。辞职社保会在离职后十五天内办理社保转移。用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。