时间要追溯到1898年4月的一天，中东铁路修筑考察队发现，在今“九站”方位，沿江一带地势稍高，树木也很多，于是决定将深水码头建在这个地方。由于此处在第九工程段的工程区内，就叫它“九站码头，俗称“小九站”，自此沿用至今。

当时的九站码头为货运码头，后经改造成为现在的去往太阳岛等地的轮渡码头。