是的，基本农田建厂房通常必须拆除。基本农田是受到国家特殊保护的耕地，主要用于粮食等农产品的生产，其保护和管理受到严格的法律法规约束。根据《中华人民共和国基本农田保护条例》和《土地管理法》的相关规定，禁止在基本农田上建房、挖砂、采石、采矿、取土等破坏基本农田的活动。如果违反了这些规定，相关建筑物和其他设施通常会被要求拆除，并可能面临罚款等法律责任。

因此，如果您在基本农田上建设了厂房，根据法律法规的规定，您可能需要拆除这些建筑物，以恢复基本农田的种植条件。具体的拆除要求可能会因地区、具体情况和法律法规的变化而有所不同，建议您咨询当地相关部门或法律专业人士以获取准确的信息和建议。