如果农村信用社的借款逾期，而对方不同意协商还款，建议尽快向法院起诉申请强制执行。在审判过程中，法院将以事实为依据进行调解，最终决定支付金额及时间。

在强制执行过程中，农村信用社应积极与债务人联系，以便在进行财产保全或强制执行过程中，及时拿回拖欠款项。此外，值得注意的是，农村信用社应在借贷合同中约定明确的违约金及利息等条款，以便在借款逾期时进行索赔。