蔬菜超市的库存处理方式如下：

分类存放 。蔬菜、水果等产品品类较复杂，应明确划分仓库，分区存放，如蔬菜、水果在保鲜区，一些冷冻产品在冷冻区，一些不易腐烂的产品在常温区等。

定时调整 。定时对库存进行调整，以增加空间的利用，维持统一的库存管理原则和方法。

保持唯一区域原则 。商品库存的区域原则上维持唯一区域的原则或某一小范围内唯一区域的原则。

库存管理还应遵循对应原则、安全原则等。