如果拼多多商家之前没有在平台上交过押金，几年后再来开店是否算新店，需要看平台的具体规定。通常情况下，如果商家之前没有在拼多多平台上开过店，或者之前的店铺已经被注销且没有违规记录，那么再次开店时，按照平台的流程和要求进行注册和开店操作，会被视为新店。

不过，即使被视为新店，商家仍然需要满足拼多多的开店条件和要求，包括提供必要的证件和资料，缴纳相应的保证金等。这些规定旨在保障消费者的权益和平台的稳定运营。

建议商家在准备开店之前，先仔细阅读拼多多的开店指南和相关规定，了解清楚平台的政策和要求，以便更好地进行店铺的开设和运营。