国务院保交楼政策资金的监管主要由财政部、住房城乡建设部以及国家开发银行等相关部门共同负责。其中，财政部负责统筹筹措资金，制定政策和规定；住房城乡建设部负责制定保障性住房建设计划，组织实施保障性住房供给和保障的政策和规定；而国家开发银行则作为国务院保障性住房专项建设基金的托管银行，负责基金的管理、投资和监督等工作。同时，各地方政府也要建立统一的监管机制，加强资金使用管理，确保国务院保障性住房政策的落实和有效执行。